Nguồn cung thủy sản của EU chủ yếu vẫn phụ thuộc vào nhập khẩu. Tổng khối lượng thủy sản nhập khẩu từ năm 2006 đến 2011 đã tăng thêm khoảng 500.000 tấn đạt mức kỷ lục 9.548 triệu tấn. Thủy sản nhập khẩu chiếm 65%, mức phụ thuộc cao nhất kể từ khi thành lập EU với 27 thành viên, trong đó nhập khẩu một số loài chính như cá thịt trắng, ngày càng tăng.
Một vài loài đã trở thành then chốt của thị trường như cá thịt trắng đánh bắt tự nhiên (cá tuyết meluc), các loài cá nước ngọt (cá tra), cá ngừ, cá hồi, surimi nguyên liệu. Một số loại làm nguyên liệu chính như thủy sản đóng block và surimi nguyên liệu là những mặt hàng nhập khẩu quan trọng, do năng lực sản xuất của EU còn hạn chế.
Phát triển nuôi trồng thủy sản một cách lâu dài giúp tăng nguồn cung cấp của từng loài, tạo sự ổn định cả về chất lượng và khối lượng của nguồn cung.
Một số nước thuộc Châu Phi, Ca-ri-bê, và Thái Bình Dương như Namibia và Nam Phi nằm trong top 10 nhà cung cấp cá meluc hàng đầu cho thị trường EU, nhưng về tổng thể Trung Quốc đã trở thành nhà cung cấp thủy sản lớn nhất cho thị trường này.
EU là thị trường cá ngừ lớn nhất thế giới, trong đó hầu hết cá ngừ đồ hộp và chỉ khoảng 4% cá ngừ nhập khẩu là sản phẩm tươi.